FAQs da Aula 2

 

O que é e para que serve o modelo 3D?

 

Exemplo:

 

COX-2 canina para desenvolvimento de AINEs (antiinflamatórios não esteroidais)

 

Problema 1: não existe a estrutura 3D (Estrutura terciária, tridimensional) para a COX-2 canina, 

 

Solução: existe a estrutura 1D (Estrutura primária ⇒ sequência de aminoácidos) ==> posso modelar, isto é estabelecer uma estrutura tridimensional para a COX-2 canina a partir de uma estrutura 3D determinada, por exemplo, para a COX-2 humana.

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Problema 2: ausência de sequência de aminoácidos

Solução: preciso buscar as infomrações no DNA (genes). Genes podem conter introns + exons, então preciso do mRNA que contêm somente as sequências de exons ⇒ transcrição reversa ⇒ enzima viral (transcriptase reversa) cDNA. Fazer o cDNA é importante para clonar um gene que poderá servir para produzir a protéina em escala para estudo como alvo terapêutico.

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Podem ser sequências “parecidas” ou não?

 

Caso COX (enzima aracdonato ciclooxigeanase)

 

COX-1 constitutiva (fisiológica) não mexam nela!!!

COX-2 induzida no processo inflamatório: inibir alivia a inflamação e dor!!!

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Caso betalactamase

 

Enzimas parecidas de diferentes microrganismos: é bom para a quimioterapia antimicrobiana. Quanto mais abrangente melhor: vai atingir mais bactérias.

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Qual a diferença entre template e modelo?

 

Template: estrutura de raio-X que serve de molde para definir uma estrutura 3D para a proteína que quero estudar

 

Modelo: proteína que quero estudar e não existe a estrutura de raio-X

 

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